La Secretaría del CICTE es el cuerpo de implementación del Comité Interamericano Contra el Terrorismo, que tiene la tarea de apoyar a los Estados Miembros en sus esfuerzos de prevenir y contrarrestar el terrorismo.
La Secretaría del CICTE brinda asistencia política y técnica a sus Estados Miembros a través de diferentes programas acordados en su Plan de Trabajo anual, tales como: Ciberseguridad, Controles Fronterizos, Financiamiento de Terrorismo, Prevención de la Proliferación de Armas de Destrucción Masiva y Extremismo Violento.
CICTE forma parte de la Secretaría de Seguridad Multidimensional.
La Secretaría tiene entre sus principales funciones:
- Proporcionar soporte técnico y administrativo para las sesiones de CICTE y mantener la comunicación y coordinación entre las sesiones.
- Proporcionar asistencia técnica y capacitación a los Estados Miembros en respuesta de sus necesidades y solicitudes.
- Coordinar actividades con otras organizaciones internacionales, regionales y subregionales.