A Secretaria do CICTE é o órgão de implementação do Comitê Interamericano contra o Terrorismo, encarregado de apoiar os Estados Membros em seus esforços para prevenir e combater o terrorismo.
A Secretaria do CICTE oferece assistência política e técnica aos seus Estados Membros por meio de diversos programas acordados em seu Plano de Trabalho anual, tais como: Cibersegurança, Controles Fronteiriços, Financiamento do Terrorismo, Prevenção da Proliferação de Armas de Destruição em Massa e Extremismo Violento.
O CICTE faz parte da Secretaria de Segurança Multidimensional.
A Secretaria tem entre as suas principais funções:
- Fornecer suporte técnico e administrativo para as sessões do CICTE e manter a comunicação e a coordenação entre as sessões.
- Oferecer assistência técnica e capacitação aos Estados Membros em resposta às suas necessidades e solicitações.
- Coordenar atividades com outras organizações internacionais, regionais e sub-regionais.