Después de la firma de los Acuerdos Paz en 1992, las primeras reformas se centraron en alcanzar mayores grados de democratización y consenso de la sociedad, dejando atrás el tema de la descentralización (Fundación Salvadoreña para el Desarrollo Económico y Social FUSADES (2009) Reforma Institucional y Descentralización Municipal Capítulo VI en Las Instituciones Democráticas en El Salvador: Valoración de Rendimiento y Plan de Fortalecimiento).

En el año 2000, el gobierno de El Salvador, a través de la Secretaría Técnica de la Presidencia (STP), elaboró el documento "Política de Descentralización," el cual concibe a la descentralización como el proceso de transferencia de competencias, recursos y capacidad de decisión entre diferentes niveles de organización del Gobierno Nacional.

Posteriormente, en julio de 2007, la STP presentó el documento "Política Nacional de Descentralización", el cual establece el marco institucional para la descentralización y los lineamientos generales para su implementación.  

Entre las principales normativas de El Salvador que hacen referencia a la descentralización se encuentran la Constitución Política y el Decreto Legislativo 274 "Código Municipal", publicado el 5 de febrero de 1986. Este último tiene por objeto desarrollar los principios constitucionales referentes a la organización, funcionamiento y ejercicio de las facultades autónomas de los municipios (Art. 1 del "Código Municipal", publicado el 31 de enero de 1986).

El territorio de la República de El Salvador se divide en departamentos donde hay un Gobernador propietario y un suplente nombrados por el Órgano Ejecutivo (Art. 200 de la Constitución Política).

El Gobernador es el representante del Presidente y le corresponde apoyar, coordinar y controlar las acciones, proyectos y programas de las diferentes dependencias del gobierno central en el departamento para lograr la eficacia y la eficiencia en sus objetivos y metas (Decreto 54 "La creación de gabinetes de gestión  departamental", publicado el 14 de mayo, 2010).

Los departamentos se dividen en municipios, los cuales están regidos por un Concejo  conformado por un Alcalde (quien preside el Concejo), un síndico y dos o más Regidores (Art. 202 de la Constitución). El número de Regidores  se elige de acuerdo a la proporción de la población (Art. 24 del Código Municipal).

El Art. 203 de la Constitución establece que los municipios serán autónomos en lo económico, en lo técnico y en lo administrativo, rigiéndose por un Decreto Legislativo 274 "Código Municipal", publicado el 5 de febrero de 1986. Además, los Municipios están obligados a colaborar con otras instituciones públicas en los planes de desarrollo nacional o regional.  

La Secretaría Técnica de la Presidencia (STP) tiene a su cargo la promoción de la descentralización del Estado entre las diferentes instituciones gubernamentales. Además, estimula a que las instituciones gubernamentales se enmarquen en la "Política Nacional de Descentralización" establecida en 2000. Asimismo, la STP ha formulado estudios e investigaciones vinculados al tema de la descentralización.

La STP se ha encargado de monitorear el proceso de descentralización iniciado en el año 2000, evaluando los avances que los diferentes sectores (salud, educación, infraestructura vial, agua potable y alcantarillado y desarrollo local) han tenido en el proceso de descentralización.

Asimismo, en El Salvador se cuenta con el concurso de la Comisión Nacional de Desarrollo Local (CONADEL) creada a través del Decreto Ejecutivo 25 "Creación de la Comisión Nacional de Desarrollo Local", publicada el 12 de mayo de 2005. La importancia de la CONADEL radica en que estableció los mecanismos de coordinación e información necesarios para que las diferentes instituciones involucradas en procesos de desarrollo local y descentralización propongan políticas y estrategias para su consideración. Además, se encargaba de informar al Presidente de la República, a través de la Coordinadora de la misma, de todos los avances que se realizaban en cuanto al cumplimiento de su objetivo (Arts. 7 y 8 del Decreto Ejecutivo 25 "Creación de la Comisión Nacional de Desarrollo Local", publicada el 12 de mayo de 2005).

La "Política Nacional de Descentralización" establece un conjunto de lineamientos y mecanismos generales para realizar un adecuado proceso de transferencia de competencias de manera ordenada y gradual, el cual deberá ser acompañado por un proceso de fortalecimiento institucional cuya calidad técnica y dotación de recursos necesarios esté a cargo de la entidad central que transfiere.

Asimismo, y con el fin de maximizar la sostenibilidad de los servicios descentralizados, la entidad designada a cargo de coordinar los procesos de descentralización deberá fortalecer la capacidad de generación de los recursos propios de los gobiernos locales y transferir proporcionalmente los recursos financieros necesarios hacia la unidad receptora. Esto deberá hacerse de acuerdo al marco jurídico y los planes de descentralización correspondientes. 

Bajo este marco diversas instituciones encargadas de apoyar a los gobiernos municipales cuentan con diferentes proyectos para ayudarlos en el desarrollo de sus competencias y la obtención y generación de recursos financieros para implementar proyectos.

A continuación se describen los proyectos e iniciativas que llevan a cabo algunas instituciones para apoyar la descentralización y la transferencia de competencias y recursos hacia los municipios:

1. El Instituto Salvadoreño de Desarrollo Municipal (ISDEM) brinda capacitación y asistencia técnica a los funcionarios municipales en las diferentes áreas de la gestión municipal. Estas capacitaciones tienen como finalidad lograr el fortalecimiento financiero, administrativo y de planificación de las administraciones locales.  Recientemente el ISDEM realizó capacitaciones para los asesores municipales con el fin de fortalecer sus conocimientos en temas como la gestión de riesgos con el fin de que brinden una respuesta rápida a la gestión de los gobiernos locales.

2. El Fondo para el Desarrollo Económico y Social de los Municipios (FODES) busca asegurar la justicia en la distribución de los recursos, tomando en cuenta las necesidades sociales, económicas y culturales de cada municipio, todo esto garantizado por la creación de un fondo de desarrollo económico y social para cada municipalidad (Decreto Legislativo 74 "Ley de Creación del Fondo para el Desarrollo Económico y Social de los Municipios" publicada el 8 de septiembre de 1988).

A través de los recursos económicos asignados por el FODES a los municipios se busca facilitar el financiamiento y la realización de obras y proyectos en beneficio de su respectiva comunidad. 

3. El Fondo de Inversión Social para el Desarrollo Local (FISDL) busca reducir la pobreza y promover el desarrollo local en el marco de la política social del gobierno. Para ello realiza la gestión de recursos y cuenta con un equipo humano competente, motivado y comprometido con los principios y objetivos institucionales.

4. El Fondo de Inversión Social para el Desarrollo Local (FISDL) es el organismo rector del Proyecto Comunidades Solidarias Rurales y del Proyecto de Fortalecimiento de los Gobiernos Locales (PFGL). El primero se encarga de apoyar municipios en pobreza extrema a través del fortalecimiento de la infraestructura básica (agua potable y saneamiento), proyectos productivos, capacitación laboral y microcrédito, y el mejoramiento de la salud y educación  entre otras acciones. 

El segundo brinda capacitaciones que permitan fortalecer la calidad de la gestión administrativa y la prestación de servicios de las organizaciones municipales a sus comunidades a través del Instituto Salvadoreño de Desarrollo Municipal (ISDEM).