La determinación de prioridades para la selección de áreas de programación, se basa en el criterio general de escoger aquellas áreas que presenten mayor potencial de desarrollo en los diferentes horizontes temporales en función de los objetivos regionales y nacionales. Para determinar este potencial se utilizaron los siguientes criterios:
a. Existencia de abundantes recursos naturales aprovechables.b. Alto interés en materia de seguridad nacional.
c. Fácil accesibilidad y disponibilidad de infraestructura de transporte.
d. Existencia de proyectos en ejecución, tanto nacionales como binacionales.
e. Presencia de numerosa población a beneficiarse con las nuevas acciones.
f. Posibilidad de generar nuevos programas y proyectos de impacto regional o nacional, principalmente una propuesta integrada de desarrollo regional.
g. Potencial de iniciar nuevas acciones binacionales y de integración.
h. Disponibilidad de información relativamente abundante.
La determinación de áreas de programación, con el propósito de implementar en ellas programas especiales de desarrollo, no impedirá que se definan acciones de alto interés regional en áreas más extensas.
